Depuis toujours le Darfour connait de nombreux conflits.
Plus récemment de 1996 à 2001, les arabes nomades s'opposent aux autres sédentaires c'est à dire une partie des ethnies locales à cause du manque de ressources naturelles. En effet le Darfour subit depuis quelques années une faible pluviométrie, la dévastation des cultures par le criquet pèlerin et la désertification des terres.
L'Etat soudanais, dépassé par les évènements, perd le contrôle de son pays, et ne protégeant pas ses frontières, laisse libre cours au trafic d'armes (venues du Tchad, d'Etiopie et de la Libye).
Les différentes tribus se sont armées et ont réglé leurs conflits indépendamment de l'Etat Soudanais. Dans un tel contexte, les plus forts se sont donc imposés (les janjawids, devenus par la suite la milice progouvernementale) semant la terreur parmi les ethnies africaines originaires du Darfour.
Simplement cette guerre oppose les forces gouvernementales (armée et milices arabes) et les deux mouvements rebelles (Mouvement de Libération du Soudan SLMA et Mouvement pour la Justice et l'Egalité MJE)