Lors de la proclamation de l'indépendance du Soudan en 1956, le Sud-Soudan composé de chrétiens et d'animistes affrontent le Nord-Soudan, composé essentielement de musulmans pour le partage du pouvoir et des richesses économiques. Le conflit se termine en 1972 mais reprend en 1983 pour prendre en fin juillet 2002.
La fin du conflit du Sud-Soudan est à l'origine du conflit actuel au Darfour.
